MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 78429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	TAA	2	6	15	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778396
2	NC_019780	GAT	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778396
3	NC_019780	TAA	3	9	130	138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778396
4	NC_019780	GCTAAC	2	12	272	283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778396
5	NC_019780	GAA	2	6	287	292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778396
6	NC_019780	TGG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428778396
7	NC_019780	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778396
8	NC_019780	AAT	2	6	413	418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778396
9	NC_019780	TGC	2	6	430	435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778396
10	NC_019780	TTA	2	6	518	523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778396
11	NC_019780	T	6	6	570	575	0 %	100 %	0 %	0 %	428778396
12	NC_019780	TTAA	2	8	605	612	50 %	50 %	0 %	0 %	428778396
13	NC_019780	CGC	2	6	658	663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778396
14	NC_019780	TGAT	2	8	675	682	25 %	50 %	25 %	0 %	428778396
15	NC_019780	AAG	2	6	717	722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778396
16	NC_019780	T	6	6	725	730	0 %	100 %	0 %	0 %	428778396
17	NC_019780	CAAA	2	8	793	800	75 %	0 %	0 %	25 %	428778396
18	NC_019780	GTT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778396
19	NC_019780	A	6	6	899	904	100 %	0 %	0 %	0 %	428778396
20	NC_019780	GTT	2	6	1004	1009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778396
21	NC_019780	TTTATC	2	12	1015	1026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428778396
22	NC_019780	TTG	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778396
23	NC_019780	AGA	2	6	1144	1149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778396
24	NC_019780	CCTA	2	8	1234	1241	25 %	25 %	0 %	50 %	428778396
25	NC_019780	TAC	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778396
26	NC_019780	A	6	6	1296	1301	100 %	0 %	0 %	0 %	428778396
27	NC_019780	GGT	2	6	1363	1368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428778396
28	NC_019780	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778396
29	NC_019780	T	6	6	1398	1403	0 %	100 %	0 %	0 %	428778397
30	NC_019780	GA	3	6	1464	1469	50 %	0 %	50 %	0 %	428778397
31	NC_019780	TTGT	2	8	1483	1490	0 %	75 %	25 %	0 %	428778397
32	NC_019780	TAAA	2	8	1494	1501	75 %	25 %	0 %	0 %	428778397
33	NC_019780	AT	3	6	1517	1522	50 %	50 %	0 %	0 %	428778397
34	NC_019780	ATCGC	2	10	1539	1548	20 %	20 %	20 %	40 %	428778397
35	NC_019780	TCCA	2	8	1567	1574	25 %	25 %	0 %	50 %	428778397
36	NC_019780	AAT	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778397
37	NC_019780	CAG	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428778397
38	NC_019780	TAA	2	6	1776	1781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778397
39	NC_019780	GAAC	2	8	1808	1815	50 %	0 %	25 %	25 %	428778397
40	NC_019780	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778397
41	NC_019780	TCA	2	6	1877	1882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778397
42	NC_019780	TGC	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778397
43	NC_019780	AAT	2	6	1905	1910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778397
44	NC_019780	TCT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778397
45	NC_019780	TGA	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778397
46	NC_019780	TCA	2	6	2118	2123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778397
47	NC_019780	AGA	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019780	ATC	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019780	ATC	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_019780	C	6	6	2407	2412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_019780	ATC	2	6	2446	2451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_019780	TC	3	6	2541	2546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_019780	CTT	2	6	2548	2553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019780	GT	4	8	2591	2598	0 %	50 %	50 %	0 %	428778398
55	NC_019780	AAC	2	6	2652	2657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778398
56	NC_019780	CTT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778398
57	NC_019780	AAG	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778398
58	NC_019780	TTG	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778398
59	NC_019780	TC	3	6	2900	2905	0 %	50 %	0 %	50 %	428778398
60	NC_019780	AAT	2	6	2925	2930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778398
61	NC_019780	TAC	2	6	2949	2954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778398
62	NC_019780	CAA	2	6	2967	2972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778398
63	NC_019780	AAC	2	6	2995	3000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778398
64	NC_019780	AGA	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778398
65	NC_019780	AAG	2	6	3043	3048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778398
66	NC_019780	GTTT	2	8	3091	3098	0 %	75 %	25 %	0 %	428778398
67	NC_019780	AGT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778398
68	NC_019780	CGC	2	6	3204	3209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428778399
69	NC_019780	TGG	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428778399
70	NC_019780	GT	3	6	3324	3329	0 %	50 %	50 %	0 %	428778399
71	NC_019780	CTC	3	9	3435	3443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428778399
72	NC_019780	A	6	6	3477	3482	100 %	0 %	0 %	0 %	428778399
73	NC_019780	ATC	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778399
74	NC_019780	TCG	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778400
75	NC_019780	CT	4	8	3550	3557	0 %	50 %	0 %	50 %	428778400
76	NC_019780	AGG	2	6	3642	3647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428778400
77	NC_019780	GAA	2	6	3667	3672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778400
78	NC_019780	CGCAA	2	10	3684	3693	40 %	0 %	20 %	40 %	428778400
79	NC_019780	AGAA	2	8	3746	3753	75 %	0 %	25 %	0 %	428778400
80	NC_019780	TGA	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778400
81	NC_019780	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778400
82	NC_019780	TCG	2	6	3819	3824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778400
83	NC_019780	TCAACA	2	12	3825	3836	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428778400
84	NC_019780	AAC	2	6	3914	3919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778400
85	NC_019780	TCG	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778400
86	NC_019780	CG	3	6	3952	3957	0 %	0 %	50 %	50 %	428778400
87	NC_019780	GGTCGC	2	12	3964	3975	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428778400
88	NC_019780	TGA	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778400
89	NC_019780	C	6	6	4195	4200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_019780	CCT	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019780	TAA	2	6	4219	4224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019780	ATT	2	6	4329	4334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
93	NC_019780	TTCT	2	8	4342	4349	0 %	75 %	0 %	25 %	428778401
94	NC_019780	ACT	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778401
95	NC_019780	A	6	6	4396	4401	100 %	0 %	0 %	0 %	428778401
96	NC_019780	GATAG	2	10	4410	4419	40 %	20 %	40 %	0 %	428778401
97	NC_019780	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
98	NC_019780	AT	3	6	4535	4540	50 %	50 %	0 %	0 %	428778401
99	NC_019780	CTG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778401
100	NC_019780	ATA	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778401
101	NC_019780	TGT	2	6	4589	4594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428778401
102	NC_019780	CTTC	2	8	4600	4607	0 %	50 %	0 %	50 %	428778401
103	NC_019780	ATC	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778401
104	NC_019780	TAA	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778401
105	NC_019780	CAATA	2	10	4762	4771	60 %	20 %	0 %	20 %	428778401
106	NC_019780	ATT	2	6	4847	4852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
107	NC_019780	AGAA	2	8	4859	4866	75 %	0 %	25 %	0 %	428778401
108	NC_019780	ATA	2	6	4916	4921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778401
109	NC_019780	ATC	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778401
110	NC_019780	ATT	2	6	4968	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
111	NC_019780	ACTT	2	8	4978	4985	25 %	50 %	0 %	25 %	428778401
112	NC_019780	CCA	2	6	5046	5051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428778401
113	NC_019780	TCT	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778401
114	NC_019780	GAT	2	6	5175	5180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778401
115	NC_019780	GAG	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428778401
116	NC_019780	ATT	2	6	5333	5338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778401
117	NC_019780	TGA	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778401
118	NC_019780	TCA	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778401
119	NC_019780	TGAT	2	8	5406	5413	25 %	50 %	25 %	0 %	428778401
120	NC_019780	T	8	8	5502	5509	0 %	100 %	0 %	0 %	428778401
121	NC_019780	TAA	2	6	5541	5546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
122	NC_019780	CTT	2	6	5603	5608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428778402
123	NC_019780	ACTA	2	8	5664	5671	50 %	25 %	0 %	25 %	428778402
124	NC_019780	AAC	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428778402
125	NC_019780	AGA	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778402
126	NC_019780	GGA	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428778402
127	NC_019780	ATAA	2	8	5805	5812	75 %	25 %	0 %	0 %	428778402
128	NC_019780	T	6	6	5820	5825	0 %	100 %	0 %	0 %	428778402
129	NC_019780	ATC	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778402
130	NC_019780	TTGA	2	8	5877	5884	25 %	50 %	25 %	0 %	428778402
131	NC_019780	ATT	2	6	5902	5907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778402
132	NC_019780	AAT	2	6	6015	6020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
133	NC_019780	TGA	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778402
134	NC_019780	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
135	NC_019780	ATT	2	6	6105	6110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428778402
136	NC_019780	TAA	2	6	6135	6140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778402
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149	NC_019780	CATAAA	2	12	6534	6545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_019780	ATT	2	6	6568	6573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_019780	ATAG	2	8	12749	12756	50 %	25 %	25 %	0 %	428778407
268	NC_019780	GAT	2	6	12788	12793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778407
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270	NC_019780	CATTT	2	10	12861	12870	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_019780	ATTT	2	8	13071	13078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_019780	ATC	2	6	13079	13084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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396	NC_019780	GGTT	2	8	19513	19520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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